| 物種 | 原始紀錄物種 | 類群 | 日期 | 行政區 | 資料集 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phanerochaete taiwaniana Sheng H. Wu, 1990 臺灣顯絲菌 | Phanerochaete taiwaniana Sheng H.Wu | 真菌類 | 1993-10-14 | 嘉義縣阿里山鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Trichocoma paradoxa 髮菌 | Trichocoma paradoxa Jungh. | 真菌類 | 1993-10-13 | 嘉義縣阿里山鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Ramalina 樹花屬 | Ramalina Ach., 1809 | 真菌類 | 2000-11-19 | 花蓮縣秀林鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Pseudocyphellaria 假杯點衣屬 | Pseudocyphellaria Vain., 1890 | 真菌類 | 2000-11-19 | 花蓮縣秀林鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Pseudocyphellaria 假杯點衣屬 | Pseudocyphellaria Vain., 1890 | 真菌類 | 1997-12-18 | 花蓮縣卓溪鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Usnea 松蘿屬 | Usnea Dill. ex Adans., 1763 | 真菌類 | 2000-11-19 | 花蓮縣秀林鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Heterodermia japonica 阿里山亞鈴孢衣 | Anaptychia obscurata (Nyl.) Vain. | 真菌類 | 1997-12-18 | 花蓮縣卓溪鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Leucoagaricus americanus | Leucoagaricus bresadolae (Schulzer) Bon & Boiffard | 真菌類 | 1995-09-29 | 雲林縣四湖鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Microporus affinis 相鄰小孔菌 | Microporus affinis (Blume & T.Nees) Kuntze | 真菌類 | 1999-12-01 | 南投縣埔里鎮 | National Museum of Natural Science | |
| Sticta 牛皮葉衣屬 | Sticta (Schreb.) Ach. | 真菌類 | 2000-11-19 | 花蓮縣秀林鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Sticta 牛皮葉衣屬 | Sticta (Schreb.) Ach. | 真菌類 | 1997-12-17 | 花蓮縣卓溪鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Sticta 牛皮葉衣屬 | Sticta (Schreb.) Ach. | 真菌類 | 2000-11-19 | 花蓮縣秀林鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Ophiocordyceps myrmecophila | Cordyceps myrmecophila Ces. | 真菌類 | 1998-04-21 | 南投縣埔里鎮 | National Museum of Natural Science | |
| Hymenopellis radicata 長根奧德蘑 | Oudemansiella radicata (Relhan) Singer | 真菌類 | 1994-06-17 | 南投縣埔里鎮 | National Museum of Natural Science | |
| Parmelia 梅衣屬 | Parmelia Acharius, 1803 | 真菌類 | 1993-09-25 | 南投縣信義鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Dictyophora indusiata 長裙竹蓀 | Dictyophora indusiata (Vent.) Fisch. | 真菌類 | 2001-04-27 | 南投縣埔里鎮 | National Museum of Natural Science | |
| Ramalina 樹花屬 | Ramalina Ach., 1809 | 真菌類 | 1993-09-25 | 南投縣信義鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Amauroderma rugosum 假芝 | Amauroderma rugosum (Blume & T.Nees) Torrend | 真菌類 | 1994-05-16 | 南投縣埔里鎮 | National Museum of Natural Science | |
| Parmelia 梅衣屬 | Parmelia Acharius, 1803 | 真菌類 | 1993-09-25 | 南投縣信義鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Ramalina 樹花屬 | Ramalina Ach., 1809 | 真菌類 | 1993-09-25 | 南投縣信義鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Usnea longissima Ach. 長松蘿 | Usnea longissima Ach. | 真菌類 | 1993-09-25 | 南投縣信義鄉 | National Museum of Natural Science | |
| Parmotrema austrosinense 華南裸緣梅衣 | Parmelia austrosinensis Zahlbr. | 真菌類 | 1998-01-19 | 高雄市桃源區 | National Museum of Natural Science | |
| Russula cyanoxantha 藍黃紅菇 | Russula cyanoxantha (Schaeff.) Fr. | 真菌類 | 1994-06-08 | 南投縣埔里鎮 | National Museum of Natural Science | |
| Dicephalospora rufocornea 紅硬雙頭孢菌 | Dicephalospora rufocornea (Berk. & Broome) Spooner | 真菌類 | 1995-06-08 | 南投縣埔里鎮 | National Museum of Natural Science | |
| Usnea 松蘿屬 | Usnea Dill. ex Adans., 1763 | 真菌類 | 1993-09-25 | 南投縣信義鄉 | National Museum of Natural Science |