| 物種 | 原始紀錄物種 | 類群 | 日期 | 行政區 | 資料集 | |
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| Amphora coffeaeformis Agardh Kützing | Amphora coffeaeformis Agardh Kutzing | 原藻類 | 2015-08-05 | 新北市八里區 | Investigation Current Status of River in Taiwan between 2002 to 2020 | |
| Diploneis ovalis Hilse Cleve | Diploneis ovalis Hilse Cleve | 原藻類 | 2015-08-05 | 新北市八里區 | Investigation Current Status of River in Taiwan between 2002 to 2020 | |
| Amphora bigibba Grunow 雙凸雙眉藻 | Amphora bigibba | 原藻類 | 2014-04-20 | 宜蘭縣頭城鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora 雙眉藻屬 | Amphora sp1. | 原藻類 | 2014-04-20 | 宜蘭縣頭城鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora 雙眉藻屬 | Amphora sp2. | 原藻類 | 2014-04-20 | 宜蘭縣頭城鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Navicula 舟形藻屬 | Navicula sp1. | 原藻類 | 2014-04-20 | 宜蘭縣頭城鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora 雙眉藻屬 | Amphora sp1. | 原藻類 | 2014-04-20 | 宜蘭縣頭城鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Navicula 舟形藻屬 | Navicula gottlandica | 原藻類 | 2014-04-20 | 宜蘭縣頭城鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Seminavis 彎雙眉藻屬 | Seminavis strigosa | 原藻類 | 2014-04-20 | 宜蘭縣頭城鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora 雙眉藻屬 | Amphora coffeiformis | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora 雙眉藻屬 | Amphora copulata | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora ovalis var. pediculus | Amphora pediculus | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora 雙眉藻屬 | Amphora sp1. | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Navicula 舟形藻屬 | Navicula perminuta | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Navicula 舟形藻屬 | Navicula sp1. | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Trachyneis 粗紋藻屬 | Trachyneis sp1. | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora 雙眉藻屬 | Amphora copulata | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Amphora ovalis var. pediculus | Amphora pediculus | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Diploneis subovalis Cleve | Diploneis subovalis | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Gomphonema truncatum Ehrenberg | Gomphonema truncatum | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Gomphonema 異極藻屬 | Gomphonema sp1. | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Gyrosigma scalproides Rabh. Cleve 刀形布紋藻 | Gyrosigma scalproides | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Navicula 舟形藻屬 | Navicula capitatoradiata | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Navicula gregaria Donkin 群生舟形藻 | Navicula gregaria | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 | |
| Navicula rostellata Kützing | Navicula rostellata | 原藻類 | 2016-03-15 | 宜蘭縣蘇澳鎮 | 東部沿岸矽藻調查 |