| 物種 | 原始紀錄物種 | 類群 | 日期 | 行政區 | 資料集 | |
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| Melosira nummuloides Dillw. Agardh 擬貨幣直鏈藻 | Melosira nummuloides | 原藻類 | 2016-03-04 | 嘉義縣東石鄉 | 2016年南部底棲藻類調查 | |
| Melosira varians C.A. Agardh 直縫藻屬 | Melosira varians | 原藻類 | 2016-03-04 | 嘉義縣東石鄉 | 2016年南部底棲藻類調查 | |
| Synedra 針杆藻屬 | Synedra brokmanii | 原藻類 | 2016-03-04 | 嘉義縣東石鄉 | 2016年南部底棲藻類調查 | |
| Coscinodiscus 圓篩藻屬 | Coscinodiscus agapetos | 原藻類 | 2016-03-04 | 嘉義縣布袋鎮 | 2016年南部底棲藻類調查 | |
| Melosira nummuloides Dillw. Agardh 擬貨幣直鏈藻 | Melosira nummuloides | 原藻類 | 2016-03-04 | 嘉義縣布袋鎮 | 2016年南部底棲藻類調查 | |
| Thalassiosira weissflogii Grunow Fryxell & Hasle 威氏海鏈藻 | Thalassiosira weissflogii | 原藻類 | 2016-03-04 | 嘉義縣布袋鎮 | 2016年南部底棲藻類調查 | |
| Cyclotella meneghiniana Kützing 孟氏小環藻 | Cyclotella meneghiniana | 原藻類 | 2016-03-04 | 台南市北門區 | 2016年南部底棲藻類調查 | |
| Melosira varians C.A. Agardh 直縫藻屬 | Melosira varians | 原藻類 | 2016-03-04 | 台南市北門區 | 2016年南部底棲藻類調查 | |
| Skeletonema tropicum Cleve 熱帶骨條藻 | Skeletonema tropicum | 原藻類 | 2017-10-23 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira minima | 原藻類 | 2017-10-23 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira tealata | 原藻類 | 2017-10-23 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Cyclotella meneghiniana Kützing 孟氏小環藻 | Cyclotella meneghiniana | 原藻類 | 2017-10-28 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Skeletonema tropicum Cleve 熱帶骨條藻 | Skeletonema tropicum | 原藻類 | 2017-10-28 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira minima | 原藻類 | 2017-10-28 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira tenera | 原藻類 | 2017-10-28 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira tealata | 原藻類 | 2017-10-28 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Campylosira cymbelliformis A. Schmidt Grunow ex Van Heurck 舟形鞍鏈藻 | Campylosira cymbelliformis | 原藻類 | 2017-10-31 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Skeletonema tropicum Cleve 熱帶骨條藻 | Skeletonema tropicum | 原藻類 | 2017-10-31 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira minima | 原藻類 | 2017-10-31 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira tealata | 原藻類 | 2017-10-31 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Biddulphia reticulata Roper 網狀盒形藻 | Biddulphia reticulata | 原藻類 | 2017-11-20 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Cyclotella meneghiniana Kützing 孟氏小環藻 | Cyclotella meneghiniana | 原藻類 | 2017-11-20 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Skeletonema tropicum Cleve 熱帶骨條藻 | Skeletonema tropicum | 原藻類 | 2017-11-20 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira minima | 原藻類 | 2017-11-20 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 | |
| Thalassiosira 海鏈藻屬 | Thalassiosira minuscula | 原藻類 | 2017-11-20 | 台南市安平區 | 2017台南水景公園矽藻調查 |