APG系統是以分子證據及支序分類學為研究方法所提出的被子植物新分類系統，TBN植物物種樹資料現已依據APG IV調整了屬(Genus)以上階層的分類架構；部分物種或種下類群亦依據最新系統分類結果，調整其所應歸併之屬。目前同物異名收錄較完整的類群有石松類、蕨類、裸子植物及蘭科植物等，並持續更新。